导言

Cytoscape是一个开源软件平台，它可以用于可视化分子相互作用网络和生物信号通路，并将用注释，基因表达谱和其他数据进行网络整合。尽管Cytoscape最初是为生物学研究而设计的，但现在它已成为复杂网络分析和可视化的通用平台。 Cytoscape核心发布版本版提供了一组用于数据集成，分析和可视化的基本功能。 额外的特点是他拥有Apps（以前称为插件）。 这些Apps可用于网络和分子谱图分析，新布局，也支持其他文件格式，脚本以及与数据库的连接。 任何人都可以使用基于Java™技术的Cytoscape开放API开发它们，并鼓励App社区开发。 大多数应用程序可从Cytoscape App Store免费获得。

软件的下载

(如果你懒得下载，直接去微信公众号：Paper绘图后台，回复“Cytoscape”，即可获得最近两个版本的软件)

1. 百度搜索”Cytoscape”

2. 打开之后，就会出现Cytoscape的主页面

3. 目前最新版本的是3.8.0版本，我们可以直接点击下载。当然，我需要下载其他版本的Cytoscape，就需要点击download

4. 点击其他的版本

5. 这里我们点击3.7.2版本，下载安装试试

6. 根据自己的电脑配置进行选择下载，这里我选择64bit的进行下载

7. 然后双击下载的文件，点击运行

8. 进行安装

9. 选择安装的文件夹，点击下一步

10. 一直点next，直到完成

11. 然后就完成了

12. 双击桌面上的快捷方式

13. 如果没有，就打开应用程序进行查找

14. 软件打开界面

15. 下来我们就可以进行制作网络图了。 后期我们会讲解一些网络图，所以今天先出一期安装教程，说不定哪一天就出现教程了，赶紧来安装吧！